Tomato Brown Rugose Fruit Birusak mundu osoko tomate eta piperraren landareak infektatzen dituenez, hazien enpresak tomate erresistente bat hazten ari dira.
Baliabide genetiko eta genomiko aberatsak tomate-hazleen eskura zeuden tomatearen sekuentziazio genomikoaren proiektuak hasi aurretik ere. Tomate germoplasma bilduma handiak aspalditik ezarri dira hainbat tokitan. 75,000 tomate-sartze baino gehiago kontserbatzen dira mundu osoko gene-bankuetan. Handienetako bat Geneva-ko USDA genebankua da.
Tomatearen genomaren sekuentziazioa 2005ean hasi zen 14 herrialderen arteko ahalegin multinazional gisa eta 2012an amaitu zen. Ahalegin horiek asko bizkortu dira adimen artifizialaren, ikaskuntza automatikoaren eta algoritmo aurreratuen aplikazioarekin datu genetiko eta fenotipiko kantitate handiak aztertzeko.
Tomate Pan-Genoma
Boyce Thompson Institutuko ikertzaileek 2020an kalitate handiko erreferentziako genoma bat sortu zuten basa tomateentzat, tomate-pangenoma osoagoa eta erabilgarriago bat sortzeko. Fruta zaporea, tamaina eta heltzea, estresarekiko tolerantzia eta gaixotasunekiko erresistentzia duten genomaren atalak aurkitu zituzten. Neurri batean, DNAren zati oso luzeak irakur ditzaketen puntako sekuentziazio teknologiei esker, erreferentziako genoma lehendik dagoen datu-basea baino osatuagoa eta zehatzagoa da.
DNA zati laburragoak irakurtzen dituzten sekuentziazio-teknologiek mutazioak identifikatzen dituzte oinarri bakarreko mailan. Hala ere, ez dira onak DNA zati handien txertaketak, ezabaketak, inbertsioak edo bikoizketak bezalako aldaera estrukturalak aurkitzeko.
2019an, nazioarteko ikertzaile talde batek tomate-pangenoma bat eraiki zuen, filogenetikoki eta geografikoki adierazgarri diren 725 barietateren genomaren sekuentziak erabiliz. Datu-base honek jatorrizko erreferentziako genoman aurkitu ez diren 4,873 gene biltzen ditu. Gaur egungo/absenteen aldaketen analisiek gene-galera handia eta geneen eta sustatzaileen hautaketa negatibo bizia agerian utzi zuten tomatearen etxekotze eta hobekuntzan zehar.
Irakurri artikulu osoa www.seedworld.com helbidean.