Pertsonak zein tomateak forma eta tamaina ezberdinetakoak dira. Hori da gizabanako bakoitzak geneek nola jokatzen eta funtzionatzen duten eragiten duten aldaera genetikoen multzo berezia (mutazioak) duelako. Batera, milioika aldakuntza genetiko txikiek zaila egiten dute aurreikustea mutazio jakin batek nola eragingo dion gizabanakoari. Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) Zach Lippman Zach Lippman irakasleak eta Howard Hughes Medical Institute ikertzaileak erakutsi zuen nola tomateen aldaera genetikoek mutazio espezifiko batek landareari eragiten dion moduan eragin dezakeen. Tomate barietate ezberdinetan mutazioen ondorioak aurreikusteko gai izateko lanean ari da.
Mutazioen konbinazio ezberdinek tomateen tamainan eragin dezakete ezusteko. Irudi honetan, lehen zutabeak mutatu gabeko (WT) tomate bat erakusten du. Bigarren eta hirugarren zutabetan SlCV1 fruta-tamainaren genearen sustatzailearen eskualde batean (R4 edo R3) mutazio bakarra duten tomateak erakusten dira. Mutazio indibidualek eragin txikia dute fruituaren tamainan. Baina bi mutazio hauen konbinazioak (R1 + R4) fruitu askoz handiagoa ematen du.
Ikerketa honetan, Lippmanek eta bere taldeak CRISPR erabili zuten, oso zehatza eta zuzendutako geneak editatzeko tresna bat, frutaren tamaina kontrolatzen duten bi tomate-genetan, SlCV3 eta SlWUS. 60 tomate mutante baino gehiago sortu zituzten eskualde sustatzaileetan, haien adierazpena kontrolatzen duten geneetatik gertu dauden eremuetan, DNA zati txikiak kenduz. Zenbait kasutan, banakako mutazioek tomateen tamaina pixka bat handitu dute. Mutazio bikote batzuek ez zuten fruituaren tamaina batere aldatu. Konbinazio sinergiko gutxi batzuek fruituen tamaina ikaragarria eta ustekabeko hazkundea eragin zuten. Lippman-ek dio: "Benetako Grial Santua laborantza ugalketarako hau guztia aurreikustea da. Sekuentzia hau mutatzen badut, efektu hau lortuko dut. Ingeniaritza egiten ari zaren mutazioaren inguruan naturak pilatu duen beste aldaeren itsaso hori baitago, baita genoma osoan barreiatuta ere, eta horietako askok sortzen ari zaren mutazio zehatzean eragina izan dezaketelako».
Edozein bi mutazioren elkarrekintza sorta honek jatorri genetiko desberdinetan gertatzen den mutazio bakar baten ondorioak eredu ditu. Efektua giza gaixotasun batzuetan aurkitzen direnen parekoa da, non pertsona batzuek aurrez existitzen diren mutazio jakin batzuk izan ditzaketen gaixotasunak eragiten dituzten mutazioetatik babesten dituztenak.
Lippman-ek eta bere taldeak mutazio indibidualek eta konbinatuek laborearen ezaugarri batzuei nola eragiten dieten kuantifikatzen jarraituko dute. Orain arte, bi mutazio indibidualen arteko elkarrekintzak neurtu dituzte, baina genomak milioika aldaera ditu. Lippman-ek espero du nahikoa elkarrekintza neurgarri aztertzea, hazkuntza aurreikusgarriagoa eta eraginkorragoa izan dadin.
Informazio gehiago nahi izanez gero:
Cold Spring Harbor laborategia
www.cshl.edu